從小被喇嘛收養的劉曦（吳京飾），跟隨養父吉祥（洪金寶飾）護送“貢佛天珠”，怎料途中被一羣神祕人偷去。吉祥懷疑事件與多年前銷聲匿跡的“雙子門”有關，於是找到了當年的校長常忠（元華飾）。 　　爲了儘快找到丟失的天珠，吉祥以及常忠決定重組“雙子門”，從馬戲團找回雙胞胎姐妹珍珠（蔡卓妍飾）、寶珠（鍾欣桐飾）以及其餘學生。 　　苦苦追尋終於發現天珠下落，與一班似乎同是“雙子門”的人大打出手。劉曦最後搶到了“天珠”，卻誤交給常忠弟弟，常勇。 　　同時也發現了更多的祕密。