環遊世界的冒險家格列佛受邀回到小人國，因爲鄰國布羅卜丁奈格的軍艦進犯時，他曾施以援手。然而當他抵達的時候，面對的卻是氣憤、慌亂而又不知所措的小人國國民。國王明明說過要來的是傳奇巨人格列佛，可他們見到的卻是一個和普通人沒什麼兩樣的傢伙，枉費他們爲招待巨人付出了那麼多心血。失望至極的小人國國王於是下令處決格列佛。可就在這時，布羅卜丁奈格的無敵艦隊再次叩關，小人國危在旦夕。這一次，格列佛要證明，不是非得有巨人的身軀才能做大事……