400多年前，峯巒迭嶂、古老原始的中國西南大山裏，聚居着以天山族爲首的侗、苗、瑤、傣各族山民。以產靈芝仙草享譽天下的天山堡，這天歡樂非凡，人們正在爲堡主之子卡洛的滿月舉行慶典。忽然，家人報告官兵已打進城來。原來是堡主之弟洪虎勾結官府來篡位奪權。爲使天山堡後繼有人，堡主忍痛將少堡主卡洛和小郡主卡美拜託給老管家。老人不負所望，毅然將剛滿月的孫子和少堡主調換，讓兒子明偉帶少堡主去日本尋找故友玄藏。自己則痛斥叛賊抱孫跳崖身亡。10年後，逃亡日本的明偉在大俠玄藏的幫助下，將少堡主培養成了武功超羣的小忍者，取名影丸。爲給師父治傷，需到中國天山堡去取靈芝草，影丸自告奮勇與師兄月丸、霧丸登上了回國的木船。他們風雨兼程奔向天山堡，途中解救了明珠和明德姐弟。他們成爲好朋友，結伴前往天山堡。只顧趕路的5個少年被堡丁抓住，又被暗中保護他們的明偉所救。明偉萬沒想到這在這裏碰上...