天海護乘坐加里安在宇宙中搜索殘存的佐達，但是有了意外的發現——用收集宇宙中的暗黑物質來再生三重連太陽系的parts Q Machine和執行這一行動的索魯11遊星主。在索魯11遊星主否決了宇宙和三重連太陽系共存的可能性後，護下了決心。護利用複製人和複製的加離安吸引住11遊星主的主意，然後奪走parts Q machine，並把真正的加里安藏在11遊星主不敢接近的G水晶裏，不過複製人卻被遊星主俘獲。
　　J-Ark在木星決戰後被the power拋到宇宙的邊緣，發現了一些不對勁的可疑跡象。調查過程中，竟然遇到了被索魯十一遊星主追擊的真正的小護。小護將parts Q Machine交給戒道，告訴他不能讓它落入索魯11遊星主的手中。J發射ES火箭讓他們逃走，自己留下應敵，不敵被俘。從ES Window中脫出的戒道墜入地球，parts Q Machine則分裂成幾個部分。
　　地球上，小護離開1年後，初野華在遛狗（大狗狗已經有了7個兒女，名字是星期一到星期日……）途中，意外的發現自己的心上人——天海護回到了地球。可是，他卻在與戒道打鬥！
　　在法國巴黎市內，特殊犯罪調查官露娜•加迪夫•獅子王率領新型AI光龍、暗龍對奪取Q PARTS的犯罪組織Bio Net展開追捕。對方是外表像個機械骷髏的基姆萊特（Gimlet），它雖然沒有佐達、原種那樣的融合能力，但是也是個頗令人頭疼的傢伙。好在，3G也盯上了Bio Net，已經恢復肉身、成爲超進化人的獅子王凱也來到巴黎。雖然加里安被小護帶走，但是3G製造了可以藍色戰機Fantom Gao（fantom同phantom，意爲“幻影”），凱與Fantom Gao融合成外形極爲類似GaiGar的GaoFar，與基姆萊特展開搏鬥。但是沒想到這個傢伙能與一些組件組合成不同樣式，很是難纏，於是凱喚來Liner-Gao II、Drill-Gao II、Stealth-Gao III進行最終融合（不過審批手續比原來繁雜了，3G的新頭頭是個磨磨蹭蹭的面瓜老頭）。基姆萊特得機器人終於在新生勇者王GaoFighGar的黃金之錘下變成了光，而基姆萊特也被露娜打爆。
　　不情願變成改造人、終生都要披着了冷卻外套的露娜是獅子王雷牙博士的女兒，在她冷酷的外表下，其實有着一顆受過傷害的脆弱心靈。
　　但是，不是隻有Bio Net對Q Parts感興趣，存放在世界各地的Q Parts的各個部件接連被盜，而罪犯竟然是小護！ “對不起……”小護的表情雖然令人憐愛，但是他所做的事卻不能讓人原諒，他造成了猿頭寺耕助的心上人——有超感應能力的帕彼亞的死亡。憤怒的凱用GaoFighGai對一意孤行的小護宣戰，而小護則使用GaoGaiGar應戰。但出人意料的是，那個加里安竟然是全白的，莫非……
　　連黃金之錘也不敵小護的“天與地”，凱只好在雨中與小護展開“天與地”的對決。這是勇氣的決戰，小護終於倒下了。戒道突然出現擊倒了企圖暗害凱的小護，並披露了他只是複製品的事實。但此時Q Parts組成的parts Q Machine已經啓動……
　　3G發現宇宙正在縮小，世界上不斷出現災難。難道，世界要毀滅嗎？實際上，這是由於parts Q Machine回收了暗物質來使三重連太陽系再生造成的後果，3G決定再到三重連太陽系探險。地球方面對3G下達了放逐令，並命令風龍、雷龍等追擊，可實際只是做戲。
　　由於沒有積達王的ES火箭，3G只得借道加利安尼亞彗星的ES Window。但是好不容易穿過ES Window後，他們卻發現眼前是地球！登上“地球”，卻發現這裏是不完全的複製品，而本應死去的帕彼亞站在大家面前。?
　　戒道獨自展開調查，卻遇到一個同樣擁有J力量的人，正在驚訝時，卻被那人體內伸出的一堆武器所擊中（很類似金凱利的《面具》呢）……而此時基地內的其他人卻沉浸在滿足感之中，大河總裁甚至命令關閉所有AI，只有凱、露娜和擁有超能力的帕彼亞受到的影響最小。
　　凱發覺這一切都是索魯十一遊星主在搞鬼，他直接跑去挑戰，見到了獨眼、牙醫打扮的的男子——巴魯巴雷巴，原來是他發出的巴力斯粒子控制着人的思想。他進行化學融合成爲怪模怪樣的巴魯巴雷巴PLUS，使出與“Hell and Heaven”類似的“God and Devil”。雙方的威力不相上下，就在僵持時，一位遊星主掀開斗篷，他竟然是加印！加印面帶慈祥的笑容站在巴魯巴雷巴的肩上，GaoFighGar一下被穿透……
　　露娜來到一座坐落在孤島的古堡，用G石解開了J的封印，卻遭到了外形像蜜蜂的維拉斯（其實更像SM女王……）和綽號“死神”的皮亞戴克姆的攻擊，而阿貝爾也現身了。所幸命和真正的小護及時趕到，在小護的指引下，他們找到了沉睡在地下深處的J-Ark。復活的白色方舟再次升空，而阿貝爾的黑色航空母艦皮亞戴克姆PIT則出現在他們面前。戒道並沒有死，而是被紅色行星J的領導者——阿貝爾俘獲，成爲皮亞戴克姆PIT的生化電腦，這使J不能攻擊。J-Ark只得飛往宇宙，卻遭到勇者軍團的攔截。
　　在黃金之錘與J Quath的激烈碰撞之中，King J-Der漸漸不敵，J Quath消失在光芒中……但就在此時，勇者機器人們紛紛覺醒，儘管只是複製品，但是在勇氣的召喚之下，他們用身軀抵擋了黃金之錘。在光芒之中，黃金之錘、還有複製的勇者機器人們，消失了……
　　在破壞的GaoFighGar裏，憑藉勇者的呼喚和淨解的咒語，凱解開了化學迷心鎖。J分離出J Bird抵禦皮亞戴克姆的艦載飛機，不料阿貝爾下令讓戒道凍結J寶石的力量，J Bird的光之翼消失了，被皮亞戴克姆撞擊釘在J-Ark上。GaoFighGar爆炸了，小護與命攜帶昏迷的凱乘坐Liner-Gao II來到了G水晶裏。小護告訴命，加里安真正的用途是遏制三重連太陽系再生程序，也就是索魯11遊星主。只是當時由於Z主腦的攻勢太猛烈，所以加里安才被用到不同的目的上。當護將Genesic力量注入加里安時，遊星主們出現了，原來他們的原動力——增幅型G石在G水晶的Genesic聖光前會失去威力，而當力量注入加里安時G水晶會停止放光，因此他們才趁機進入G水晶。在索魯Wave的照射下，G水晶破碎了。而當加印企圖收回加里安時，卻發現加里安選擇了凱。但擁有Genesic力量的原始加里安，還是不敵遊星主的合力攻擊。就在GaiGar險些被巴魯巴雷巴PLUS的刀刺中時，命在神祕聲音（估計是小護的母親）的召喚下及時發動了原始融合。“遏制再生的力量的，是破壞的力量。破壞是重新回到起點的希望，是對無限可能性的挑戰。”
　　“Genesic承認！”G水晶的碎片化成了Genesic Machines：Protect Gao、Broken Gao、Gadget Gao、Spiral Gao、Straight Gao，衝破索魯Wave，並組成了最終勇者王•Genesic GGG，但命卻被索魯Wave擊中，命在旦夕。
　　儘管Genesic GGG比遊星主要強大，遊星主也不敵原始裝甲（Genesic Armor），但是不斷再生的能力使得他們並未落於下風。
　　面對勇者們，遊星主們紛紛融合，成爲與勇者們針鋒相對的機械。J與露娜偶然發現，在G石的Hyper Mode的感應下，J寶石能再度放出光輝，King J-Der也得以再次啓動。J發誓要奪回戒道！可是皮亞戴克姆與戰艦融合後，變成了比King J-Der更巨大的機器人皮亞•戴克姆PEAK。近身搏鬥打不過、爲了保護戒道而不能用炮擊、最強武器J Quath在與黃金之錘的對決中消失，J能否取得勝利呢？一切一齊盡在第8話“神話”給大家答案巴。