“醫龍”再次歸來！完成了日本第一例Batista手術收入後，由朝田龍太郎（坂口憲二飾）率領的小隊就被解散了。朝田回到了難民營，繼續他的國際救援。之前任職的明真大學，格局也有所變化。前小組成員伊集院登（小池徹平飾）、裏原美紀（水川麻美飾）等雖然還留守醫院，但都因醫院的情況精神不佳。這時，一封不知來歷的郵件發到了前小組成員的手上。郵件的內容是希望重組醫龍小隊。這個信息讓小組的成員都感到既興奮又忐忑。這時一位患者被送到醫院，由龍太郎適時挽救了生命。藉此機會，醫龍小隊又再次組建，一切都朝着好的方向發展着。但朝田似乎隱隱感覺着背後有人在操縱着這些事……